As vértebras dorsais dos Brontotherium por cima dos ombros eram mais longas para poderem suportar os enormes músculos do pescoço que por sua vez suportavam a pesada cabeça.
Provavelmente os seus lábios eram carnudos e a língua comprida de modo a poderem recolher os seus alimentos favoritos (caules e folhas).
No passado, espécimes expostos ao ar livre por tempestades fortes foram encontrados pelos indiosSioux. Estes acreditavam que estas criaturas provocavam trovoadas quando corriam por cima das nuvens e chamaram-lhes "cavalos trovão". Muitos dos especimes encontrados por esta tribo eram manadas que tinham sido mortas por erupções vulcânicas das Montanhas Rochosas, que estavam geologicamente activas no Eoceno.